Obbiettivi del percorso formativo:
Il Corso si propone di fornire allo studente le conoscenze di base sulle moderne metodologie computazionali ed informatiche nel campo della progettazione e dell'ottimizzazione di nuovi farmaci, della caratterizzazione a priori delle loro proprietà chimico-fisiche e farmacologiche, e dello studio a livello molecolare dei loro possibili meccanismi d'azione. Il percorso formativo è di carattere teorico anche se è previsto un percorso di esercitazioni virtuali attraverso una piattaforma web-orientata dove lo studente avrà modo di conoscere alcuni degli strumenti informatico/computazionali maggiormente utilizzati sia in ambito accademico sia nelle varie realtà industriali a carattere farmaceutico e biotecnologico. Tutto il materiale presentato durante le lezioni e le esercitazione è in lingua inglese per consentire allo studente di entrare in contatto con la terminologia scientifica correntenente utilizzata internazionalmente in questo ambito.
MMSeLAB: |
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PSF@zoomcast: |
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@sertiamoci: |
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Great Memories: |
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1. Introduzione alla progettazione di un farmaco |
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2. Ligand-based Drug Design (LBDD) | ||
Rappresentazioni Molecolari e Similarità Strutturale |
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Ipotesi Farmacoforiche |
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Superfici e Descrittori Molecolari |
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QSARs e AI : introduzione |
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QSARs: elementi di statistica |
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3. Structure-based Drug Design (SBDD) | ||
Analisi Conformazionale |
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Energetica Molecolare |
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Docking & Scoring |
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Dinamica Molecolare |
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Elementi di Chimica Quantistica |
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Per coloro che ancora non si fossero stressati abbastanza, ecco alcuni suggerimenti per procurarsi gratuitamente un "visualizzatore molecolare" per poter continuare a giocare anche in futuro: | |
1. Chimera (UCSF) |
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2. Pymol (DeLano Scientific LLC ): |
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3. VMD (UIUC): |
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5. ICM-Browser (MolSoft): |
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6. Spar and Flar Designer (Cresset) |  |
