Progettazione e Sviluppo di un Farnarco (CTF) - MMS

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Obbiettivi del percorso formativo:
Il Corso si propone di fornire allo studente le conoscenze di base sulle moderne metodologie computazionali ed informatiche nel campo della progettazione e dell'ottimizzazione di nuovi farmaci, della caratterizzazione a priori delle loro proprietà chimico-fisiche e farmacologiche, e dello studio a livello molecolare dei loro possibili meccanismi d'azione. Il percorso formativo è di carattere teorico anche se è previsto un percorso di esercitazioni virtuali attraverso una piattaforma web-orientata dove lo studente avrà modo di conoscere alcuni degli strumenti informatico/computazionali  maggiormente utilizzati sia in ambito accademico sia nelle varie realtà industriali a carattere farmaceutico e biotecnologico. Tutto il materiale presentato durante le lezioni e le esercitazione è in lingua inglese per consentire allo studente di entrare in contatto con la terminologia scientifica correntenente utilizzata internazionalmente in questo ambito.


MMSeLAB:

PSF@zoomcast:


@sertiamoci:



Great Memories:


1. Introduzione alla progettazione di un farmaco

2. Ligand-based Drug Design (LBDD)

Rappresentazioni Molecolari e Similarità Strutturale


Ipotesi Farmacoforiche


Superfici e Descrittori Molecolari


QSARs e AI : introduzione


QSARs: elementi di statistica


3. Structure-based Drug Design (SBDD)

Analisi Conformazionale


Energetica Molecolare


Docking & Scoring
Virtual Screening


Dinamica Molecolare


Elementi di Chimica Quantistica


Per coloro che ancora non si fossero stressati abbastanza, ecco alcuni suggerimenti per procurarsi gratuitamente un "visualizzatore molecolare" per poter continuare a giocare anche in futuro:
1. Chimera (UCSF)

2. Pymol (DeLano Scientific LLC ):

3. VMD (UIUC):

5. ICM-Browser (MolSoft):

6.  Spar and Flar Designer (Cresset)
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